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Das vorliegende Handbuch ist im Rahmen von Forschungsvorhaben des Länderfinanzierungsprogramms Wasser, Boden und Abfall (O6.03, O3.05) im Auftrag der Länderarbeitsgemeinschaft Wasser (LAWA) zur Umsetzung der Europäischen Wasserrahmenrichtlinie (EU-WRRL) entstanden. Es dient ab dem Jahr 2007 als Grundlage für die Überwachungsprogramme der Bundesländer an großen Fließgewässern mittels der Biokomponente Phytoplankton. Eine Bewertung mittels Phytoplankton ist nur für ausgewählte Fließgewässertypen gefordert. Das Handbuch dient als Verfahrensanleitung für die ökologische Bewertung dieser planktonführenden Fließgewässer. Es werden Probenahme und Probenkonservierung, die mikroskopische Auswertung sowie die schrittweise Berechnung der biologischen Kenngrößen (Metrics) aus den quantitativen Befunden zur Ermittlung des Gesamtbewertungsindexes mittels Phytoplankton beschrieben.